Создан крупнейший биобанк органоидов пяти видов злокачественных новообразований

Исследователи Wellcome Sanger Institute совместно с британскими клиническими центрами создали первую крупномасштабную коллекцию моделей опухолей, полученных из образцов пациентов. Биобанк включает 256 моделей колоректального рака, рака пищевода, желудка, поджелудочной железы и яичников. Результаты исследования опубликованы в журнале Nature.

Для формирования коллекции использовались свежие образцы опухолевой ткани, предоставленные пациентами медицинских центров Бирмингема, Кембриджа, Глазго, Лондона и Саутгемптона. Исследователи секвенировали ДНК органоидов, опухолевой ткани и образцов крови пациентов, что позволило сопоставить лабораторные модели с первичными новообразованиями и отслеживать изменения, возникающие при их длительном культивировании. 

На 162 органоидах ученые провели масштабный CRISPR-скрининг, последовательно отключая отдельные гены и оценивая их влияние на выживание опухолевых клеток. В результате были выявлены тысячи генетических зависимостей - как общих для разных видов рака, так и характерных для отдельных типов опухолей. 

В отдельных случаях исследователям удалось сравнить органоиды, созданные из образцов одного пациента до и после терапии. Это помогло проследить формирование лекарственной устойчивости и выявить потенциальные уязвимости резистентных опухолевых клеток. Авторы подчеркивают, что полученные результаты пока не являются готовыми методами лечения, однако биобанк может использоваться для выбора перспективных лекарственных мишеней и доклинической проверки новых терапевтических подходов.

Данные коллекции будут находиться в открытом доступе на платформе Cell Model Passports. Сами органоиды планируется распространять среди исследовательских организаций через Merck и некоммерческий репозиторий American Type Culture Collection.

Источник: Wellcome Sanger Institute - New biobank of tumour models reveals cancers’ weak spots.